Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms