Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MLH3Q9UHC1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
MLH3Q9UHC1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms