Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA9Q9UGM1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA9Q9UGM1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA9Q9UGM1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA9Q9UGM1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA9Q9UGM1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA9Q9UGM1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA9Q9UGM1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA9Q9UGM1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA9Q9UGM1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA9Q9UGM1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA9Q9UGM1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA9Q9UGM1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA9Q9UGM1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms