Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK3Q9UBP4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK3Q9UBP4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK3Q9UBP4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK3Q9UBP4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK3Q9UBP4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK3Q9UBP4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK3Q9UBP4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK3Q9UBP4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK3Q9UBP4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK3Q9UBP4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK3Q9UBP4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK3Q9UBP4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms