Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRRQ9UBK8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRRQ9UBK8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms