Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEC2Q9UBF1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEC2Q9UBF1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEC2Q9UBF1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEC2Q9UBF1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEC2Q9UBF1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEC2Q9UBF1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEC2Q9UBF1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEC2Q9UBF1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEC2Q9UBF1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEC2Q9UBF1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEC2Q9UBF1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEC2Q9UBF1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEC2Q9UBF1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEC2Q9UBF1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEC2Q9UBF1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms