Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAE1Q9UBE0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms