Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMOD2Q9NZR1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMOD2Q9NZR1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
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