Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD4Q9NZQ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms