Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms