Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDE1Q9NXR1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDE1Q9NXR1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163 ms