Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1Q9NXJ5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms