Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRNAU1APQ9NX07 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms