Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM160Q9NX00 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM160Q9NX00 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM160Q9NX00 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM160Q9NX00 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms