Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ASF1BQ9NVP2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ASF1BQ9NVP2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms