Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms