Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOPORSQ9NS56 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms