Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS00

C1GALT1, Glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1GALT1Q9NS00 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1GALT1Q9NS00 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1GALT1Q9NS00 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms