Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHST12Q9NRB3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms