Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC31BQ9NQW1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC31BQ9NQW1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms