Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYLDQ9NQC7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYLDQ9NQC7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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