Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX9Q9NQ69 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms