Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP3Q9NQ35 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NRIP3Q9NQ35 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP3Q9NQ35 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms