Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB18Q9NP72 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB18Q9NP72 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms