Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-5Q9HDB9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms