Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA1549Q9HCM3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIAA1549Q9HCM3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms