Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP29Q9HBJ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP29Q9HBJ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms