Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SP110Q9HB58 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP110Q9HB58 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms