Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF2Q9HAK2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF2Q9HAK2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms