Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAS3Q9H6U6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms