Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RETREG1Q9H6L5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RETREG1Q9H6L5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms