Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA4AQ9H3S1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms