Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNMDQ9H2S6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNMDQ9H2S6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms