Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN4Q9H254 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTBN4Q9H254 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms