Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF3Q9GZM5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms