Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR3CQ9C0K3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms