Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE41Q9C0J9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms