Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP44Q9C0F1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP44Q9C0F1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms