Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CIPCQ9C0C6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms