Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM5Q9C035 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM5Q9C035 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms