Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROPN1BQ9BZX4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms