Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM6SF1Q9BZW5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TM6SF1Q9BZW5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM6SF1Q9BZW5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
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