Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms