Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSM14BQ9BX40 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms