Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM4

GGACT, Gamma-glutamylaminecyclotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGACTQ9BVM4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGACTQ9BVM4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGACTQ9BVM4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms