Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP58Q9BVL2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms