Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV38

WDR18, WD repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR18Q9BV38 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
WDR18Q9BV38 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR18Q9BV38 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR18Q9BV38 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms