Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUD6

SPON2, Spondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPON2Q9BUD6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPON2Q9BUD6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPON2Q9BUD6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms