Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UPK3BQ9BT76 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms