Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYT17Q9BSW7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYT17Q9BSW7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYT17Q9BSW7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
SYT17Q9BSW7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYT17Q9BSW7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms